आणविक रोग विज्ञान , रोगविज्ञान की एक शाखा है जो ऊतकों, अंगों या जैविक तरल पदार्थों के भीतर अणुओं की जांच से संबंधित है जो रोग के निदान में सहायता करती है। यह रोग के उप आणविक पहलुओं पर केंद्रित है। एंटीबॉडी आधारित इम्यूनोफ्लोरेसेंस ऊतक परख, डीएनए अनुक्रमण, मात्रात्मक पीसीआर आणविक विकृति विज्ञान में नियोजित तकनीकें हैं।