प्रोटीन अणु सेलुलर वातावरण के संरचनात्मक और कार्यात्मक घटक हैं। वैज्ञानिक समुदाय और शिक्षाविदों में प्रोटीन की मात्रा का आकलन एक नियमित प्रक्रिया रही है। प्रोटीन के अनुक्रमण ने प्रोटीन के रहस्यों का खुलासा किया और प्रोटीन नेटवर्क और कैस्केडिंग घटनाओं की जटिल संरचनात्मक और कार्यात्मक घटनाओं को समझने में सहायता की। प्रोटीन अनुक्रमण के लिए कई विधियों का उपयोग किया जाता है जिनमें एंजाइम आधारित विधियाँ, मास स्पेक्ट्रोमेट्री आधारित विधियाँ और स्वचालित अनुक्रमण विधियाँ शामिल हैं।
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