पुरातात्विक रिकॉर्ड में कई बीमारियाँ मौजूद हैं। कंकाल के ऊतकों में मानव पुरापाषाण विज्ञान साक्ष्य का पहला विस्तृत संदर्भ विकृति की पहचान करने में सहायक था, हड्डी में परिवर्तन के आधार पर पाए जाने वाले कुछ रोगों में तपेदिक, कुष्ठ रोग, सिफलिस शामिल हैं।