आंतरिक चिकित्सा और सार्वजनिक स्वास्थ्य पर सहयोगात्मक अनुसंधान के अंतर्राष्ट्रीय जर्नल

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क्लेरिसा एरिका

एकल-कोशिका आरएनए अनुक्रमण से प्राप्त डेटा विभिन्न कोशिका प्रकारों की आणविक विविधता को प्रकट कर सकता है। माउस स्पाइनल कॉर्ड के लिए सेल प्रकार एटलस के हाल के प्रकाशनों को अभी तक संयोजित नहीं किया गया है। यहाँ, एकल-कोशिका ट्रांसक्रिप्टोम डेटा का उपयोग करके, हम स्पाइनल सेल प्रकारों का एक एटलस बनाते हैं, विभिन्न डेटासेट को संदर्भ के एकल फ़्रेम में संयोजित करते हैं। हम प्रसवोत्तर कोशिका प्रकार की अंतःक्रियाओं का एक पदानुक्रमित ढाँचा प्रस्तुत करते हैं, जिसमें स्थान संगठन के उच्चतम स्तर के रूप में कार्य करता है, उसके बाद न्यूरोट्रांसमीटर की स्थिति, परिवार और दर्जनों परिष्कृत आबादी होती है। हम वयस्क स्पाइनल कॉर्ड में प्रत्येक प्रकार के न्यूरोनल सेल के भौगोलिक वितरण का मानचित्र बनाते हैं और प्रत्येक के लिए एक संयोजन मार्कर कोड को मान्य करते हैं। हम कई प्रसवोत्तर कोशिका प्रकारों के बीच जटिल वंशावली लिंक भी प्रदर्शित करते हैं। सेल प्रकार की पहचान के मानकीकरण में सहायता के लिए, हम ओपन-सोर्स सेल प्रकार क्लासिफायर SeqSeek भी बनाते हैं। इस कार्य द्वारा विभिन्न प्रकार की स्पाइनल कोशिकाओं, उनकी आणविक व्यवस्था और उनके जीन अभिव्यक्ति प्रोफाइल की एकीकृत समझ प्रदान की जाती है।