अनुक्रम विश्लेषण जैव सूचना विज्ञान की एक शाखा है जिसमें किसी भी जीव से संबंधित उत्पन्न जीन, प्रोटीन या जीनोम अनुक्रम का विश्लेषण शामिल है। अनुक्रम विश्लेषण तकनीक किसी विशेष अनुक्रम में छिपे पैटर्न का विश्लेषण करने के लिए गणितीय मॉडलिंग विधियों जैसे हिडन मार्कोव मॉडल (एचएमएम), डीएसएसपी, स्थिति विशिष्ट स्कोरिंग मैट्रिक्स (पीएसएसएम) का उपयोग करती है।
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