ग्लाइकोप्रोटीन में ऑलिगोसेकेराइड श्रृंखलाएं होती हैं जो पॉलीपेप्टाइड साइड चेन से सहसंयोजक रूप से जुड़ी होती हैं। सैकेराइड श्रृंखलाएं, जिन्हें ग्लाइकेन कहा जाता है, को दो प्रमुख तरीकों से पॉलीपेप्टाइड से जोड़ा जा सकता है। ग्लाइकोप्रोटीन का पहला वर्ग ओ-लिंक्ड ग्लाइकन्स है। इनमें आमतौर पर एन-एसिटाइलगैलेक्टोसामाइन होता है जो ग्लाइकोसिडिक बॉन्ड के माध्यम से थ्रेओनीन या सेरीन के ओ-टर्मिनस से जुड़ा होता है। ग्लाइकोप्रोटीन के अन्य वर्ग एन-लिंक्ड ग्लाइकेन हैं। इनमें एन-एसिटाइलग्लुकोसामाइन और शतावरी अवशेष के एन-टर्मिनस के बीच एक ग्लाइकोसिडिक बंधन शामिल है
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